Tὸ Ἵδρυμα Βυζαντινῆς Μουσικολογίας συστήθηκε ἀπὸ τὴν Ἱερὰ Σύνοδο τῆς Ἐκκλησίας τῆς Ἑλλάδος κατὰ τὴν πζ΄ συνεδρίαν της τῆς 24ης Ἰουνίου τοῦ 1970, ὕστερα ἀπὸ εἰσήγηση τοῦ μακαριστοῦ μητροπολίτου Σερβίων καὶ Κοζάνης κυροῦ Διονυσίουπρὸς τὴν ἐπὶ τῆς Θείας Λατρείας καὶ Τέχνης Μόνιμον Συνοδικὴν Ἐπιτροπήν. Λειτουργεῖ σύμφωνα μὲ τὸν Κανονισμὸ 17/1981 τῆς Ἱερᾶς Συνόδου τῆς Ἐκκλησίας τῆς Ἑλλάδος (Εκκλησια ἔτος ΝΖ΄, τεῦχος Β΄, ἀρ. 3/16. 9.1981), καὶ ΦΕΚ 135, τεῦχος πρῶτο, 10.11.1982.
Πρῶτος ἐπιστημονικὸς συνεργάτης (1970) καὶ κατόπιν, ἀπ’ τὸ ἔτος 1999 μέχρι τὸ 2022, Διευθυντὴς καὶ ἐκδότης τῶν ἐκδοτικῶν σειρῶν τοῦ Ἱδρύματος διετέλεσε ὁ Ὁμότιμος Καθηγητὴς τοῦ Πανεπιστημίου Ἀθηνῶν Γρηγόριος Θ. Στάθης, στὸν ὁποῖο ἡ Ἱερὰ Σύνοδος, σὲ εἰδικὴ τελετή, τὸ 2022, ἀπένειμε τὸν τιμητικὸ τίτλο τοῦ Ἐπιτίμου Διευθυντοῦ τοῦ ΙΒΜ.
Ἀπὸ τὸ 2022 τὸ Ἵδρυμα διευθύνει ὁ Γρηγόριος Ἀναστασίου, Ἀναπληρωτὴς Καθηγητὴς τοῦ Τμήματος Μουσικῶν Σπουδῶν τοῦ ΕΚΠΑ καὶ Πρωτοψάλτης.
Ἐπιστημονικὸς Συνεργάτης τοῦ Ἱδρύματος διατελεῖ ὁ Πολύκαρπος Τύμπας, Μουσικολόγος, ὑποψ. Διδάκτωρ στὸ Τμῆμα Μουσικῶν Σπουδῶν τοῦ ΕΚΠΑ καὶ Πρωτοψάλτης.